Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms