Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms