Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms