Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABCB6Q9NP58 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB6Q9NP58 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms