Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YTHDC2Q9H6S0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms