Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms