Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS16Q9H269 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS16Q9H269 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms