Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms