Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF541Q9H0D2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF541Q9H0D2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms