Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4CQ9C0C4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms