Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms