Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A5Q9BY07 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms