Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms