Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TXNDC17Q9BRA2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC17Q9BRA2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms