Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EBF4Q9BQW3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EBF4Q9BQW3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms