Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSG101Q99816 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSG101Q99816 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms