Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms