Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP19Q99542 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP19Q99542 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms