Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIN3AQ96ST3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms