Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSRNP1Q96S65 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms