Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms