Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf48Q96LS8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf48Q96LS8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms