Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms