Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLMNQ96JQ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLMNQ96JQ2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms