Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms