Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCANQ96GW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCANQ96GW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms