Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms