Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARPC1AQ92747 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms