Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBXQ8WY36 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms