Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2Q2Q8WVN8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q2Q8WVN8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms