Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BRK1Q8WUW1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms