Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3TC2Q8TF17 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms