Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms