Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms