Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCF23Q7RTU1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms