Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP1Q7RTM1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms