Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNDC1Q76NI1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNDC1Q76NI1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms