Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM5Q71RC9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms