Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms