Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms