Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms