Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSK4Q6SA08 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms