Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms