Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC183Q5T5S1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms