Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP188Q5SRE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms