Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HABP4Q5JVS0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms