Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms