Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC38Q502W7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms