Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL38Q2WGJ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms