Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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